Category | Mycobacterial species | Sample source | Total | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Water | Soil | Faecal | ||||||||
House hold | Valley dam | Stream | Pig shelter | Cattle kraal | Water source | Pig | Cattle | |||
RGM | M. fortuitum- peregrinum complex | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 1 | 12 | |
M. parafortuitum | 1 | 1 | ||||||||
M. vanbaaleni | 1 | 1 | ||||||||
M. chubuense | 1 | 1 | ||||||||
Total RGM | 2 | 1 | 4 | 1 | 5 | 1 | 1 | 15 | ||
SGM | M. avium complex | 2 | 1 | 1 | 1 | 5 | ||||
M. intracellulare | 1 | 1 | 7 | 9 | ||||||
M. gordonae | 4 | 1 | 5 | |||||||
M. terrae | 1 | 1 | ||||||||
M. arupense | 1 | 1 | ||||||||
M. nonchromogenicum | 3 | 1 | 1 | 5 | ||||||
M. hiberniae | 1 | 1 | ||||||||
M. engbaekii | 1 | 1 | 2 | |||||||
M. kubicae | 2 | 2 | ||||||||
M. senuense | 1 | 1 | ||||||||
M. simiae | 1 | 1 | ||||||||
Total SGM | 15 | 2 | 2 | 1 | 3 | 9 | 0 | 1 | 33 | |
Grand total | 17 | 3 | 2 | 5 | 4 | 14 | 1 | 2 | 48 | |
% | 35.4 | 6.3 | 4.2 | 10.4 | 8.3 | 29.2 | 2.1 | 4.2 | 100 |